Les structures déconcentrées sont les démembrements au niveau régional, provincial, départemental et infra-départemental. Elles sont rattachées au Secrétariat général.

Les structures déconcentrées sont :

• les Directions régionales de l'agriculture et des aménagements hydrauliques (DRAAH) subdivisées en Directions provinciales (DPAAH), en Zones d’appui technique (ZAT) et en Unités d’animation technique (UAT) ;
• les Centres de promotion rurale (CPR). Les DRAAH sont dirigées par des Directeurs régionaux nommés par décret pris en Conseil des ministres sur proposition du Ministre. Le Directeur régional à rang de Directeur général.

Les Directions régionales comprennent les services suivants :

le Service Régional des Etudes et des Statistiques Sectorielles (SRESS) ;

• le Service Régional du Foncier Rural, de la Formation et de l’Organisation du Monde Rural (SRFOMR) ;
• le Service Régional de la Promotion de l’Economie Rurale (SRPER) ;
• le Service Régional des Aménagements et des Productions Agricoles (SRAPA).

Les Services d’appui de la DRAAH sont :

• le Secrétariat de la Direction Régionale (SDR) ;
• le Service Administratif et Financier (SAF) ;
• le Service des Ressources Humaines (SRH) ;

La composition et les attributions des directions et de services des DRAAH sont déterminées par arrêté ministériel. Les Services techniques des DRAAH sont dirigés par des Chefs de service nommés par arrêté du Gouverneur de région sur proposition du Directeur régional. Les Directions provinciales de l'agriculture et des aménagements hydrauliques (DPAAH) sont dirigées par des Directeurs provinciaux nommés par décret pris en Conseil des ministres sur proposition du Ministre. Les Zones d’appui technique (ZAT) et les Unités d’animation technique de (UAT) sont dirigées par des Chefs de Zone et des chefs d’unité nommés par un arrêté du Gouverneur de région, sur proposition du Directeur régional de l’agriculture et des aménagements hydrauliques (DRAAH). Les Chefs de zones ont rang de Chef de services. Les CPR sont dirigés par un Directeur nommé par décret pris en Conseil des ministres sur proposition du Ministre.

Les Centres de promotion rurale organes suivants :

• une direction ;
• un secrétariat ;
• un service administratif et financier ;
• un service des études et des stages ;
• un service de la production.

La composition et les attributions des organes des Centres de promotion rurale (CPR) sont déterminés par un arrêté du Ministériel.